يقع في طريق مار فرنسيس مقابل دير اللاتين الكبير بالقرب من الباب الجديد.ينسب إلى مؤسسه وواقفه السلطان المملوكي الملك المنصور سيف الدين قلاوون (689-678هـ/ 1290-1279م)، الذي شيده ووقفه في سنة (686هـ/1287م) كما يفيد النقش المثبت على حائطه المطل على الطريق العام.
يتوصل إلى المسجد عبر باب يقع في الجدار الشمالي منه، يؤدي على بيت الصلاة مباشرةً.ويتخذ هذا المسجد شكل المستطيل ،وهو مغطى بقبو برميلي،وفي منتصف واجهته الجنوبية محراب حجري يتكون من حنية متوجة.
ويبدو أن المسجد المنصوري قد أهمل بعض الوقت، ما أدى على خرابه والخلط في تسميته الأصلية،فمثلاً كان يعرف حتى فترة قريبة بالمسجد القلندري، تم إصلاحه مؤخراً، ونقش اسمه الأصلي (المسجد المنصوري) على لوحة من الرخام ثبتت فوق مدخله .